调查显示，截至6月底，黄河流域和西北内陆棉区棉花长势基本正常;长江流域出现涝灾，对棉花生长造成影响，棉花蕾铃数量同比减少，采摘时间预计延迟。若后期天气正常，预计2016年新棉单产110.3公斤/亩，较上年提高8.3%，总产量483.9万吨，减少7.2%。具体情况如下：
1、长江流域雨水频繁，其他地区天气正常。调查显示，77.5%的受访农户反映天气较好和一般，同比增加2个百分点，较近三年均值下降0.3个百分点;71.7%的农户反映灾害轻度发生，同比下降11.6个百分点，较近三年均值下降5.4个百分点。分区域看，黄河流域棉区90.1%的农户反映天气较好和一般，同比提高9.1个百分点，73.4%的农户反映灾害轻度发生，同比提高5.7个百分点;长江流域棉区降水过多，局部出现涝灾，影响花蕾成铃，51.5%的农户反映天气较好和一般，同比下降13.8个百分点，69.3%的农户反映灾害轻度发生，同比下降4.8个百分点;西北内陆棉区79.1%的农户反映天气较好和一般，同比提高2.9个百分点，71.8%的农户反映灾害轻度发生，同比下降19.3个百分点。
2、棉花病虫害轻度发生，雨后病虫害防治受考验。调查显示，88.8%的受访农户反映病害轻度发生，同比下降8.1个百分点，较近三年均值下降3.3个百分点;79.5%的农户反映虫害轻度发生，同比下降13.9个百分点，较近三年均值下降8个百分点。分区域看，黄河流域棉区97.3%的农户反映病害轻度发生，82.7%的农户反映虫害轻度发生;长江流域棉区83.7%的农户反映病害轻度发生，78.1%的农户反映虫害轻度发生;西北内陆棉区87.1%的农户反映病害轻度发生，78.8%的农户反映虫害轻度发生。不过，7月份中国南方的强降雨导致部分棉田被淹，给病虫害防治工作带来极大考验。
3、棉花蕾铃数量同比减少，预计采摘时间延迟。调查显示，棉花果枝数较上年同期减少8.1%，现蕾数减少18.5%，成铃数减少14.6%。74.8%的受访农户预计规模采摘时间基本正常，同比下降2.2个百分点;预计采摘提前的农户占4.1%，同比下降1.5个百分点;预计延迟的占21.1%，同比提高3.7个百分点。分区域看，黄河流域6.3%的农户预计采摘时间延迟，同比提高3.5个百分点;长江流域26.1%的农户预计采摘时间延迟，同比提高1个百分点;西北内陆棉区25.1%的农户预计采摘时间延迟，同比提高9.5个百分点。
4、预计棉花平均单产高于上年。若后期天气正常，预计2016年中国棉花平均单产为110.3公斤/亩，较上年提高8.3%，较近三年均值提高1.2%。按照国家棉花市场监测系统5月份实播面积调查结果4385.1万亩测算，预计2016年中国棉花总产量为483.9万吨，同比减少7.2%，较近三年均值减少15.4%。分区域看，黄河流域棉区平均单产较上年下降1.2%，产量预计为66.7万吨，减少25.5%;长江流域棉区平均单产较上年下降5.9%，产量预计为37.5万吨，减少32%;西北内陆棉区平均单产较上年提高8.9%，产量预计为376.8万吨，增加1.2%，其中新疆平均单产较上年提高8.9%，产量预计为374.4万吨，增加2%。